Raziskovalci UL FPP so vključeni v raziskave vpliva novega koronavirusa na promet. Gospodarsko usmerjen pristop je privedel do matematičnega modeliranja poteka pandemije. Razvili so dva modela, logistični in klasični model SIR. Razvita Matlab programa sta dobila ime fitVirus in fitVirusCOVID19.
Sprva sta delovala skoraj izključno na podlagi podatkov iz Kitajske. Pokazalo se je, da se je napoved poteka okužb zelo dobro pokrivala z dejanskim potekom. Od takrat se modela uporabljata tudi za druge države in regije po vsem svetu.
Izkazalo se je, da modela zelo dobro delujeta predvsem za države, ki so uvedle strogo karanteno. Model namreč predvideva predvsem stalno populacijo, enakomerno mešanje ljudi in enako verjetnost okrevanja med okuženimi. Model temelji na podatkih, zato je njegova napoved le tako dobra kot so dobri podatki. Z novimi ali spremenjenimi podatki, se spreminja tudi napoved.
Namen modela je le za raziskovalno in pedagoško delo.
Reference:
M. Batista, Estimation of the final size of the coronavirus epidemic by the logistic model (Feb 2020)
M. Batista, Estimation of the final size of the coronavirus epidemic by the SIR model. (Feb 2020),
M. Batista, Estimation of the final size of the COVID-19 epidemic,
M. Batista, Estimation of the final size of the second phase of the coronavirus epidemic by the logistic model,
M. Batista, Estimation of a state of Corona 19 epidemic in August 2020 by multistage logistic model: a case of EU, USA, and World (Update September 2020),
M. Batista, On the Reproduction Number in Epidemics, Journal of Biological Dynamics, Volume 15, Issue 1, 22 November 2021) Pages 623–634.
M. Batista, A. Turnšek, How effective is vaccination protection? (December 2021), https://doi.org/10.1101/2021.12.17.21267980
Programska orodja:
estimate_R
fitVirusCOVID19
fitVirus
fitVirusXX
SIR model:
Compartmental models in epidemiology
The Mathematics of Infectious Diseases
Notes On R0
epiEstim model:
Anne Cori, Neil M. Ferguson, Christophe Fraser, Simon Cauchemez , A New Framework and Software to Estimate Time-Varying Reproduction Numbers During Epidemics, American Journal of Epidemiology, Volume 178, Issue 9, 1 November 2013, Pages 1505–1512
R.N. Thompson, J.E. Stockwin, R.D. van Gaalen, J.A. Polonsky, Z.N. Kamvar, P.A. Demarsh, E. Dahlqwist, S. Li, E. Miguel, T. Jombart, J. Lessler, S. Cauchemez, A. Cori, Improved inference of time-varying reproduction numbers during infectious disease outbreaks, Epidemics, Volume 29, 2019
Serijski interval:
Hiroshi Nishiura, Natalie M Linton, Andrei R. Akhmetzhanov, Serial interval of novel coronavirus (2019-nCoV) infections
Zhanwei Du et al., Serial Interval of COVID-19 among Publicly Reported Confirmed Cases
Sheikh Taslim Ali et al. , Serial interval of SARS-CoV-2 was shortened over time by nonpharmaceutical interventions
Podatki:
gov.si
NIJZ
worldometer
Dodatne informacije
Kaj je R?
Milan Batista: On the reproduction number in epidemics, Journal of Biological Dynamics, Volume 15, Issue 1, Pages 623-634
Drugo mnenje:
Arhiv dnevnih napovedi razvoja epidemije v Sloveniji
13. 2. 2022
12. 2. 2022
11. 2. 2022
10. 2. 2022
9. 2. 2022
7. 2. 2022
6. 2. 2022
5. 2. 2022
4. 2. 2022
3. 2. 2022
2. 2. 2022
31. 1. 2022
30. 1. 2022
29. 1. 2022
28. 1. 2022
27. 1. 2022
26. 1. 2022
25. 1. 2022
24. 1. 2022
23. 1. 2022
21. 1. 2022
20. 1. 2022
19. 1. 2022
18. 1. 2022
17. 1. 2022
16. 1. 2022
15. 1. 2022
14. 1. 2022
13. 1. 2022
12. 1. 2022
11. 1. 2022
10. 1. 2022
9. 1. 2022
8. 1. 2022
7. 1. 2022
6. 1. 2022
5. 1. 2022
4. 1. 2022
2. 1. 2022
1. 1. 2022
29. 12. 2021
28. 12. 2021
27. 12. 2021
26. 12. 2021
25. 12. 2021
24. 12. 2021
23. 12. 2021
22. 12. 2021
21. 12. 2021
20. 12. 2021
19. 12. 2021
18. 12. 2021
17. 12. 2021
16. 12. 2021
15. 12. 2021
14. 12. 2021
13. 12. 2021
12. 12. 2021
10. 12. 2021
9. 12. 2021
8. 12. 2021
7. 12. 2021
6. 12. 2021
5. 12. 2021
4. 12. 2021
3. 12. 2021
2. 12. 2021
1. 12. 2021
30. 11. 2021
29. 11. 2021
28. 11. 2021
27. 11. 2021
26. 11. 2021
25. 11. 2021
24. 11. 2021
23. 11. 2021
22. 11. 2021
21. 11. 2021
20. 11. 2021
19. 11. 2021
18. 11. 2021
17. 11. 2021
16. 11. 2021
15. 11. 2021
14. 11. 2021
13. 11. 2021
12. 11. 2021
10. 11. 2021
9. 11. 2021
8. 11. 2021
7. 11. 2021
6. 11. 2021
5. 11. 2021
4. 11. 2021
3. 11. 2021
2. 11. 2021
1. 11. 2021
31. 10. 2021
30. 10. 2021
29. 10. 2021
28. 10. 2021
27. 10. 2021
26. 10. 2021
25. 10. 2021
24. 10. 2021
23. 10. 2021
22. 10. 2021
21. 10. 2021
20. 10. 2021
19. 10. 2021
31. 5. 2021
29. 5. 2021
28. 5. 2021
27. 5. 2021
26. 5. 2021
25. 5. 2021
24. 5. 2021
23. 5. 2021
22. 5. 2021
21. 5. 2021
20. 5. 2021
19. 5. 2021
19. 5. 2021 (regije)
18. 5. 2021
17. 5. 2021
17. 5. 2021 (regije)
16. 5. 2021
15. 5. 2021
14. 5. 2021
14. 5. 2021 (regije)
13. 5. 2021
13. 5. 2021 (regije)
12. 5. 2021
12. 5. 2021 (regije)
11. 5. 2021
11. 5. 2021 (regije)
10. 5. 2021
10. 5. 2021 (regije)
9. 5. 2021
8. 5. 2021
8. 5. 2021 (regije)
7. 5. 2021
7. 5. 2021 (regije)
6. 5. 2021
6. 5. 2021 (regije)
5. 5. 2021
5. 5. 2021 (regije)
4. 5. 2021
4. 5. 2021 (regije)
3. 5. 2021
3. 5. 2021 (regije)
2. 5. 2021
2. 5. 2021 (regije)
1. 5. 2021
1. 5. 2021 (regije)
30. 4. 2021
30. 4. 2021 (regije)
26. 4. 2021
26. 4. 2021 (regije)
25. 4. 2021
25. 4. 2021 (regije)
24. 4. 2021
24. 4. 2021 (regije)
23. 4. 2021
23. 4. 2021 (regije)
22. 4. 2021
22. 4. 2021 (regije)
21. 4. 2021
21. 4. 2021 (regije)
20. 4. 2021
19. 4. 2021
19. 4. 2021 (regije)
18. 4. 2021
18. 4. 2021 (regije)
17. 4. 2021
16. 4. 2021
15. 4. 2021
14. 4. 2021
13. 4. 2021
12. 4. 2021
11. 4. 2021
10. 4. 2021
8. 4. 2021
8. 4. 2021 (regije)
7. 4. 2021
7. 4. 2021 (regije)
6. 4. 2021
6. 4. 2021 (regije)
5. 4. 2021
5. 4. 2021 (regije)
4. 4. 2021
4. 4. 2021 (regije)
3. 4. 2021
3. 4. 2021 (regije)
2. 4. 2021
2. 4. 2021 (regije)
1. 4. 2021
1. 4. 2021 (regije)
30. 3. 2021
30. 3. 2021 (regije)
29. 3. 2021
28. 3. 2021
28. 3. 2021 (regije)
27. 3. 2021
27. 3. 2021 (regije)
26. 3. 2021
26. 3. 2021 (regije)
25. 3. 2021
25. 3. 2021 (regije)
24. 3. 2021
24. 3. 2021 (regije)
23. 3. 2021
23. 3. 2021 (regije)
22. 3. 2021
21. 3. 2021
21. 3. 2021 (regije)
20. 3. 2021
20. 3. 2021 (regije)
19. 3. 2021
19. 3. 2021 (regije)
18. 3. 2021
18. 3. 2021
17. 3. 2021
17. 3. 2021 (regije)
16. 3. 2021
16. 3. 2021 (regije)
15. 3. 2021
15. 3. 2021 (regije)
14. 3. 2021
13. 3. 2021
13. 3. 2021 (regije)
12. 3. 2021
12. 3. 2021 (regije)
11. 3. 2021
11. 3. 2021 (regije)
10. 3. 2021
10. 3. 2021 (regije)
9. 3. 2021
9. 3. 2021 (regije)
8. 3. 2021
8. 3. 2021 (regije)
6. 3. 2021
6. 3. 2021 (regije)
5. 3. 2021
4. 3. 2021
3. 3. 2021
2. 3. 2021
1. 3. 2021
28. 2. 2021
27. 2. 2021
26. 2. 2021
25. 2. 2021
24. 2. 2021
22. 2. 2021
21. 2. 2021
20. 2. 2021
19. 2. 2021
18. 2. 2021
17. 2. 2021
17. 2. 2021 (regije)
16. 2. 2021
8. 2. 2021
7. 2. 2021
6. 2. 2021
5. 2. 2021
4. 2. 2021
3. 2. 2021
2. 2. 2021
2. 2. 2021 (kratko)
1. 2. 2021
1. 2. 2021 (regije)
31. 1. 2021
31. 1. 2021 (regije)
30. 1. 2021
29. 1. 2021
29. 1. 2021 (regije)
28. 1. 2021
28. 1. 2021 (regije)
27. 1. 2021
27. 1. 2021 (regije)
26. 1. 2021
26. 1. 2021 (regije)
25. 1. 2021
25. 1. 2021 (regije)
25. 1. 2021 (primerjave)
24. 1. 2021
24. 1. 2021 (regije)
23. 1. 2021
22. 1. 2021
22. 1. 2021 (regije)
21. 1. 2021
21. 1. 2021 (regije)
20. 1. 2021
20. 1. 2021 (regije)
19. 1. 2021
19. 1. 2021 (regije)
18. 1. 2021
15. 1. 2021
15. 1. 2021 (regije)
13. 1. 2020
12. 1. 2021
12. 1. 2021 (regije)
5. 1. 2021
5. 1. 2021 (regije)
4. 1. 2021
31. 12. 2020
31. 12. 2020 (regije)
30. 12. 2020
30. 12. 2020 (regije)
29. 12. 2020
29. 12. 2020 (regije)
28. 12. 2020
28. 12. 2020 (regije)
27. 12. 2020
26. 12. 2020
25. 12. 2020
25. 12. 2020 (regije)
24. 12. 2020
24. 12. 2020 (regije)
23. 12. 2020
23. 12. 2020 (regije)
22. 12. 2020
21. 12. 2020
20. 12. 2020
19. 12. 2020
18. 12. 2020
17. 12. 2020
16. 12. 2020
15. 12. 2020
11. 12. 2020
4. 12. 2020
3. 12. 2020
2. 12. 2020
30. 11. 2020
29. 11 2020
27. 11 2020
26. 11. 2020
25. 11. 2020
24. 11. 2020
23. 11. 2020
20. 11. 2020
19. 11. 2020
18. 11, 2020
17. 11. 2020
16. 11. 2020
15. 11. 2020
14. 11. 2020
13. 11. 2020
12. 11. 2020
11. 11. 2020
10. 11. 2020
Raziskovalci UL FPP so vključeni v raziskave vpliva novega koronavirusa na promet. Gospodarsko usmerjen pristop je privedel do matematičnega modeliranja poteka pandemije. Razvili so dva modela, logistični in klasični model SIR. Razvita Matlab programa sta dobila ime fitVirus in fitVirusCOVID19.