COVID-19 napovednik

slo COVID 11 novRaziskovalci UL FPP so vključeni v raziskave vpliva novega koronavirusa na promet. Gospodarsko usmerjen pristop je privedel do matematičnega modeliranja poteka pandemije. Razvili so dva modela, logistični in klasični model SIR. Razvita Matlab programa sta dobila ime fitVirus in fitVirusCOVID19.


Sprva sta delovala skoraj izključno na podlagi podatkov iz Kitajske. Pokazalo se je, da se je napoved poteka okužb zelo dobro pokrivala z dejanskim potekom. Od takrat se modela uporabljata tudi za druge države in regije po vsem svetu.

 

Izkazalo se je, da modela zelo dobro delujeta predvsem za države, ki so uvedle strogo karanteno. Model namreč predvideva predvsem stalno populacijo, enakomerno mešanje ljudi in enako verjetnost okrevanja med okuženimi. Model temelji na podatkih, zato je njegova napoved le tako dobra kot so dobri podatki. Z novimi ali spremenjenimi podatki, se spreminja tudi napoved.

 

Namen modela je le za raziskovalno in pedagoško delo.

 

Reference:

M. Batista, Estimation of the final size of the coronavirus epidemic by the logistic model (Feb 2020) 
M. Batista, Estimation of the final size of the coronavirus epidemic by the SIR model. (Feb 2020),
M. Batista, Estimation of the final size of the COVID-19 epidemic
M. Batista, Estimation of the final size of the second phase of the coronavirus epidemic by the logistic model
M. Batista, Estimation of a state of Corona 19 epidemic in August 2020 by multistage logistic model: a case of EU, USA, and World (Update September 2020), 
M. Batista, On the Reproduction Number in Epidemic (September 18, 2020). Available at SSRN: or http://dx.doi.org/10.2139/ssrn.3694932 

Programska orodja:

estimate_R

fitVirusCOVID19
fitVirus

fitVirusXX

 

SIR model:

Compartmental models in epidemiology

The Mathematics of Infectious Diseases

Notes On R0   

 

epiEstim model:

Anne Cori, Neil M. Ferguson, Christophe Fraser, Simon Cauchemez , A New Framework and Software to Estimate Time-Varying Reproduction Numbers During Epidemics, American Journal of Epidemiology, Volume 178, Issue 9, 1 November 2013, Pages 1505–1512

R.N. Thompson, J.E. Stockwin, R.D. van Gaalen, J.A. Polonsky, Z.N. Kamvar, P.A. Demarsh, E. Dahlqwist, S. Li, E. Miguel, T. Jombart, J. Lessler, S. Cauchemez, A. Cori, Improved inference of time-varying reproduction numbers during infectious disease outbreaks, Epidemics, Volume 29, 2019

 

Serijski interval:

Hiroshi Nishiura, Natalie M Linton, Andrei R. Akhmetzhanov, Serial interval of novel coronavirus (2019-nCoV) infections

Zhanwei Du et al., Serial Interval of COVID-19 among Publicly Reported Confirmed Cases

Sheikh Taslim Ali et al. , Serial interval of SARS-CoV-2 was shortened over time by nonpharmaceutical interventions

 

Podatki:

gov.si

NIJZ

worldometer

 

Dodatne informacije

Kaj je R?

 

Drugo mnenje:

 

Arhiv dnevnih napovedi razvoja epidemije v Sloveniji

 

31. 5. 2021

29. 5. 2021

28. 5. 2021

27. 5. 2021

26. 5. 2021

25. 5. 2021

24. 5. 2021

23. 5. 2021

22. 5. 2021

21. 5. 2021

20. 5. 2021

19. 5. 2021

19. 5. 2021 (regije)

18. 5. 2021

17. 5. 2021

17. 5. 2021 (regije)

16. 5. 2021

15. 5. 2021

14. 5. 2021

14. 5. 2021 (regije)

13. 5. 2021

13. 5. 2021 (regije)

12. 5. 2021

12. 5. 2021 (regije)

11. 5. 2021

11. 5. 2021 (regije)

10. 5. 2021

10. 5. 2021 (regije)

9. 5. 2021

8. 5. 2021

8. 5. 2021 (regije)

7. 5. 2021

7. 5. 2021 (regije)

6. 5. 2021

6. 5. 2021 (regije)

5. 5. 2021

5. 5. 2021 (regije)

4. 5. 2021

4. 5. 2021 (regije)

3. 5. 2021

3. 5. 2021 (regije)

2. 5. 2021

2. 5. 2021 (regije)

1. 5. 2021

1. 5. 2021 (regije)

30. 4. 2021

30. 4. 2021 (regije)

26. 4. 2021

26. 4. 2021 (regije)

25. 4. 2021

25. 4. 2021 (regije)

24. 4. 2021

24. 4. 2021 (regije)

23. 4. 2021

23. 4. 2021 (regije)

22. 4. 2021

22. 4. 2021 (regije)

21. 4. 2021

21. 4. 2021 (regije)

20. 4. 2021

19. 4. 2021

19. 4. 2021 (regije)

18. 4. 2021

18. 4. 2021 (regije)

17. 4. 2021

16. 4. 2021

15. 4. 2021

14. 4. 2021

13. 4. 2021

12. 4. 2021

11. 4. 2021

10. 4. 2021

8. 4. 2021

8. 4. 2021 (regije) 

7. 4. 2021

7. 4. 2021 (regije)

6. 4. 2021

6. 4. 2021 (regije)

5. 4. 2021

5. 4. 2021 (regije)

4. 4. 2021

4. 4. 2021 (regije)

3. 4. 2021

3. 4. 2021 (regije)

2. 4. 2021

2. 4. 2021 (regije)

1. 4. 2021

1. 4. 2021 (regije)

30. 3. 2021

30. 3. 2021 (regije)

29. 3. 2021

28. 3. 2021

28. 3. 2021 (regije)

27. 3. 2021

27. 3. 2021 (regije)

26. 3. 2021

26. 3. 2021 (regije)

25. 3. 2021

25. 3. 2021 (regije)

24. 3. 2021

24. 3. 2021 (regije)

23. 3. 2021

23. 3. 2021 (regije)

22. 3. 2021

21. 3. 2021

21. 3. 2021 (regije)

20. 3. 2021

20. 3. 2021 (regije)

19. 3. 2021

19. 3. 2021 (regije)

18. 3. 2021

18. 3. 2021

17. 3. 2021

17. 3. 2021 (regije)

16. 3. 2021

16. 3. 2021 (regije)

15. 3. 2021

15. 3. 2021 (regije)

14. 3. 2021

13. 3. 2021

13. 3. 2021 (regije)

12. 3. 2021

12. 3. 2021 (regije)

11. 3. 2021

11. 3. 2021 (regije)

10. 3. 2021

10. 3. 2021 (regije)

9. 3. 2021

9. 3. 2021 (regije)

8. 3. 2021

8. 3. 2021 (regije)

6. 3. 2021

6. 3. 2021 (regije)

5. 3. 2021

4. 3. 2021

3. 3. 2021

2. 3. 2021

1. 3. 2021

28. 2. 2021

27. 2. 2021

26. 2. 2021

25. 2. 2021

24. 2. 2021

22. 2. 2021

21. 2. 2021

20. 2. 2021

19. 2. 2021

18. 2. 2021

17. 2. 2021

17. 2. 2021 (regije)

16. 2. 2021

8. 2. 2021

7. 2. 2021

6. 2. 2021

5. 2. 2021

4. 2. 2021

3. 2. 2021

2. 2. 2021

2. 2. 2021 (kratko)

1. 2. 2021

1. 2. 2021 (regije)

31. 1. 2021

31. 1. 2021 (regije)

30. 1. 2021

29. 1. 2021

29. 1. 2021 (regije)

28. 1. 2021

28. 1. 2021 (regije)

27. 1. 2021

27. 1. 2021 (regije)

26. 1. 2021

26. 1. 2021 (regije)

25. 1. 2021

25. 1. 2021 (regije)

25. 1. 2021 (primerjave)

24. 1. 2021

24. 1. 2021 (regije)

23. 1. 2021

22. 1. 2021

22. 1. 2021 (regije)

21. 1. 2021

21. 1. 2021 (regije)

20. 1. 2021

20. 1. 2021 (regije)

19. 1. 2021

19. 1. 2021 (regije)

18. 1. 2021

15. 1. 2021

15. 1. 2021 (regije)

13. 1. 2020

12. 1. 2021

12. 1. 2021 (regije)

5. 1. 2021

5. 1. 2021 (regije)

4. 1. 2021

31. 12. 2020

31. 12. 2020 (regije)

30. 12. 2020

30. 12. 2020 (regije)

29. 12. 2020

29. 12. 2020 (regije)

28. 12. 2020

28. 12. 2020 (regije)

27. 12. 2020

26. 12. 2020

25. 12. 2020

25. 12. 2020 (regije)

24. 12. 2020

24. 12. 2020 (regije)

23. 12. 2020

23. 12. 2020 (regije)

22. 12. 2020

21. 12. 2020

20. 12. 2020

19. 12. 2020

18. 12. 2020

17. 12. 2020

16. 12. 2020

15. 12. 2020

    11. 12. 2020     

    4. 12. 2020

3. 12. 2020       

     2. 12. 2020

   30. 11. 2020

    29. 11 2020

    27. 11 2020

26. 11. 2020

25. 11. 2020

    24. 11. 2020

23. 11. 2020

20. 11. 2020

19. 11. 2020

18. 11, 2020

17. 11. 2020

16. 11. 2020

15. 11. 2020

14. 11. 2020

13. 11. 2020

12. 11. 2020

11. 11. 2020

10. 11. 2020